Tris、EDTA与TE:从明确盐型配制pH8.0 DNA保存液

配100 mL Tris与EDTA母液,再制100 mL TE;明确Tris碱分子量、EDTA二水盐和定容顺序。

01本篇适用条件

用于普通纯化非感染性DNA的缓冲液配制,固定为100 mL 1 M Tris-HCl pH8.0、100 mL 0.5 M EDTA pH8.0和100 mL 1×TE。Tris从Tris base配起,EDTA从乙二胺四乙酸二钠二水合物配起。TE含1 mM EDTA,适合常规DNA保存,但不自动适合所有需Mg²⁺的酶反应;不作为RNA无核酸酶等级保证。

02实验原理

Tris经盐酸调pH形成缓冲体系;其pH受温度影响,应在记录的室温测定。EDTA二钠在接近pH8时更易溶解,不能把未溶白粉简单滤掉而仍标0.5 M。两种母液分别合格后按稀释关系配TE。

03安全与适用范围

NaOH及HCl有腐蚀性,酸碱中和可放热;戴手套、实验服和护目镜,在通风橱由受训人员加酸碱。首次使用者优先用现成合格母液完成TE配制,其余步骤在指导下完成。小量逐步加碱,容器不密闭,不把灼热液放入定容瓶。

04材料与仪器

  • Tris base分子量121.14;EDTA-Na₂·2H₂O分子量372.24;纯水及标签清楚的现成1 M HCl、5 M NaOH。
  • 适用于Tris测量的pH电极,pH7与pH10校准液,温度计、搅拌器、耐化学品烧杯。
  • 读数到0.001 g的天平、100 mL定容容器、P200/P1000与量取酸碱工具、洁净带盖瓶;需无菌液时备经确认适用的0.22 μm滤器。

05配液与用量

液体100 mL配方关键定义
1 M Tris-HCl pH8.0Tris base12.114 g,水先约60 mL,以1 M HCl逐步调pH8.0,最后水至100 mL不用12.191 g;酸量由实测pH决定
0.5 M EDTA pH8.0EDTA二钠二水盐18.612 g,水先约60 mL,以5 M NaOH逐步调pH8.0并溶清,最后水至100 mL无水盐质量不同,不能互换
1×TE pH8.01 M Tris-HCl pH8.0 1.00 mL,0.5 M EDTA pH8.0 0.200 mL,水补至100 mL10 mM Tris、1 mM EDTA
不含EDTA的对照保存液1 M Tris-HCl pH8.0 1.00 mL,水补至100 mL10 mM Tris;后续酶体系可优先考虑

酸碱不是固定配方体积,不写“加若干毫升必然到pH8.0”。若液体体积已接近100 mL仍未调好或未溶清,停下重配或选择较浓且已知浓度的酸碱由受训者处理,不能超体积后仍标原浓度。

06时间安排

阶段条件时间/完成标志
校准、称量室温15分钟
Tris溶解和调pH室温搅拌15–25分钟
EDTA逐步加碱溶解室温搅拌20–40分钟至澄清
回温定容、配TE及核验室温20分钟

07开始前的准备

检查盐型和分子量,把0.5 M×0.1 L×372.24 g/mol=18.612 g写入记录。用适当pH7/10标准校准电极,记录校准斜率和温度;只用pH试纸不能承担最终精确调pH。每种母液各保留独立容器,工作期间控制总体积,待完全回室温后才最终校正pH和定容。

08逐步操作

  1. 标记Tris、EDTA、TE和不含EDTA对照四只瓶,写目标浓度及pH8.0;确认原料标签不是Tris-HCl粉末或EDTA游离酸。
  2. 按仪器要求用pH7和pH10液校准,冲洗电极并吸去外壁水滴,记录室温;不擦刮玻璃球泡。
  3. 称12.114 g Tris base入烧杯,加约60 mL水,搅拌至完全无颗粒。
  4. 测pH,分次加入现成1 M HCl,边搅拌边等待稳定;接近8.0时逐滴加入,并记录累计用量。
  5. 将Tris溶液回到记录的室温,确认pH8.0后转入定容容器,用少量水洗烧杯并合并,补至100 mL后混匀。
  6. 另称18.612 g EDTA二钠二水盐,加约60 mL水搅拌;初期不完全溶解属于预期,不把白粉滤除。
  7. 分次缓慢加入5 M NaOH,每次混匀后观察溶解和pH,接近pH8时减小加量;避免局部强碱飞溅。
  8. EDTA澄清并回室温后最终调到pH8.0,转移并水洗容器,将总量补至100 mL,充分混匀,另取小份复测pH。
  9. 在TE定容容器先放约80 mL水,加入1.00 mL Tris母液和0.200 mL EDTA母液;分别勾选来源瓶。
  10. 用水补至100 mL,盖紧颠倒10次,取小份测室温pH并记录;小份测液不倒回。
  11. 另配100 mL不含EDTA的10 mM Tris对照,标签明显区分;做DNA后续酶反应时计算实际EDTA带入量。
  12. 若本次用途要求无菌,使用经确认适用的0.22 μm滤器分别过滤并收集到洁净瓶,标明处理方式;过滤不能证明无DNase或RNase。
  13. 以洁净10 mM Tris及TE分别配相同小份商业教学DNA,在本次使用时核对溶解和检测空白;没有长期稳定性试验不宣称保质期已验证。
  14. 写瓶签浓度、盐型、pH/测温、配制和处理日期、操作者;洁净室温加盖保存,使用前查浑浊和污染,DNA本身按项目冷藏或冷冻。

09结果判断与质控

三个目标液应澄清,室温pH在本次预设8.0±0.1教学范围内,配液记录可复算。TE中EDTA不是“越多越保护”;例如反应中带入2 μL TE至20 μL时EDTA为0.1 mM,须结合所用酶的Mg²⁺条件评估。外观澄清不能证明无核酸酶,样本关键用途需专门等级和验证。

10实验记录模板

液名/批次原料/盐型/质量g起始水mLHCl或NaOH浓度/累计mLpH/温度定容mL过滤方式配制人
待填待填约60或80待填待填100待填待填
TE所用Tris批次/体积EDTA批次/体积最终浓度复核对照及空白记录异常处理
待填/1 mL待填/0.2 mL10/1 mM待填待填

11常见问题与排错

EDTA始终有白粉

核实是否二钠二水盐、pH与加碱方法;若接近终体积仍无法溶清,重配,不先定容再大量加碱。

pH隔天变化

查温度差、校准、污染和是否充分混匀;重新在同温测定,不直接沿用热液或冷液读数。

DNA酶反应受抑

核算EDTA带入浓度,使用不含EDTA的Tris重新纯化或稀释DNA并验证,不擅自向酶反应补未知量Mg²⁺。

12参考资料

  • 用户提供《分子生物学实验方法 老文档 仅供参考》PDF物理第55、58页;《分子生物学实验手册 来源网络仅供参考》PDF物理第225、227页:TE定义与EDTA溶解线索。旧版Tris的121.91 g/L已按121.14 g/mol纠正,不采用含酚TBS配方。
  • Promega,DNA Purification技术指南(Elution),查阅日期2026-11-02:核对TE的DNA保存用途、EDTA与下游Mg²⁺反应的兼容性边界;本篇母液质量依据明确盐型分子量及物质的量守恒复算,酸碱体积以实测pH决定。
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做完最后一步,再核对原始记录。填写实际用量、起止时间与观察结果;遇到异常,先记录,再查看排错说明。