01本篇适用条件
非致病S. cerevisiae EGY48,染色体LexA响应LEU2报告基因,p8op-lacZ带URA3;固定使用pGilda-HIS3编码LexA-bait、pB42AD-TRP1编码B42-prey,均为已测序且已确认保有三质粒的转化株。本篇为定向配对验证,不是整库筛选/建库或动物病毒蛋白实验。普通无害蛋白对为试验;已验证LexA-TFIIB/B42-W7可作为同体系互作阳性。
02实验原理
LexA融合蛋白结合报告启动子,互作把B42激活域带近启动子,启动LEU2与lacZ。bait自身转录激活、prey非特异结合和表达不足都可产生假象;LEU2生长与lacZ显色两个报告均符合对照才是候选证据,仍须独立生化/细胞方法支持直接互作。
03安全与适用范围
仅用身份明确的非致病实验室样本;穿实验服、戴手套和护目镜,由熟悉本法的指导者带教。先核对仪器量程、试剂SDS及废物收集容器;培养物按本单位微生物废物流程处理。不得把本例直接外推到临床、感染性或未知来源材料。
04材料与仪器
- 已确认的5组EGY48三质粒株:bait+prey、bait+空B42、空LexA+prey、双空及同体系已验证互作阳性;每组至少3个独立单克隆。
- 不含碳源的10×合成培养基母液,终1×含YNB6.7 g/L及匹配dropout补充物;维护培养基缺His/Trp/Ura但含Leu;报告培养基另缺Leu。20%葡萄糖、20%半乳糖、20%棉子糖、2%琼脂、X-gal20 mg/mL。
- 30°C摇床/培养箱、分光光度计、无菌96孔板/移液器、独立划线平板、相同光照拍照条件。表达核查需抗LexA及适配B42融合蛋白检测。
05配液与用量
| 项目 | 本例配制/用量 | 核对点 |
|---|---|---|
| 100 mL葡萄糖维护液 | 无碳源10×SD/-His/-Trp/-Ura10 mL+20%葡萄糖10 mL+水80 mL | 终1×、2%葡萄糖;含Leu,不据此判报告阳性 |
| 100 mL Gal/Raf诱导液 | 对应10×无碳源SD10 mL+20%半乳糖10 mL+20%棉子糖5 mL+水75 mL | 终2%Gal、1%Raf;液体培养含Leu |
| 100 mL诱导报告琼脂 | 10×SD/-His/-Trp/-Ura/-Leu10 mL+20%Gal10 mL+20%Raf5 mL+琼脂2 g+水补足 | 灭菌基础液冷却后加无菌糖;终1×、2%琼脂 |
| 含Leu显色平板X-gal | 100 mL已缓冲、含Leu且显色阳性验证通过的Gal/Raf培养基加20 mg/mL X-gal200 μL,水体积预扣0.2 mL | 终40 μg/mL,避光;pH及配方为本地验证记录项 |
| 10倍梯度 | 归一OD600=0.2菌液20 μL+无菌水180 μL | 1、1:10、1:100、1:1000各取5 μL点样 |
06时间安排
| 阶段 | 条件 | 预计时间 |
|---|---|---|
| 维护培养 | 30°C选择培养基 | 16–24小时 |
| 预诱导 | 30°C Gal/Raf、含Leu | 6小时起始条件 |
| 报告培养 | 30°C | 每日拍照,3–5天 |
| 独立重复/核查 | 重新划线及表达核查 | 约1周 |
07开始前的准备
核对宿主、三个标记和每个载体启动子;本例pGilda与旧pLexA不同,必须如实记载,不能把Gal4-HIS3/3-AT筛选加入本LexA-LEU2路线。先在含Leu诱导培养基比较5组活性/毒性;显色平板必须先以报告阳性验证颜色,X-gal和缓冲条件不能仅靠称量就视为合格。

原Fig1完整保留A各LexA-ValRS N端构建体及X-gal蓝色反应,Bβ-半乳糖苷酶定量,C融合蛋白Western及PGK上样对照。原研究测试转录激活域,说明仅LexA融合片段自身即可激活报告;本篇先检验诱饵自激活,再解释互作,不能只凭蓝色或生长宣布阳性。
08逐步操作
- 逐株核对EGY48和p8op-lacZ/pGilda/pB42AD身份、融合方向及测序,给五配对各三个独立克隆编号。
- 各克隆分别划线在葡萄糖SD/-His/-Trp/-Ura维护板,30°C培养2–3天,检查能形成独立菌落。
- 各取单菌落入3 mL葡萄糖维护液,30°C通气培养16–24小时;保持各组容器、液量和振荡条件一致。
- 测OD600并拍培养状态,若某bait在维护或诱导条件显著抑制生长,先记录毒性,不将少生长直接判无互作。
- 各取0.5 mL菌液,3000×g室温离心3分钟,以1 mL无菌水洗两次,去葡萄糖。
- 重悬并接入3 mL含Leu的Gal/Raf选择液,使初始OD600=0.2,30°C通气诱导6小时,记录终OD。
- 将各诱导菌液以水归一至OD600=0.2,按20+180 μL配10倍、100倍、1000倍稀释,不把不同密度直接比较。
- 画板图,分别在葡萄糖维护板、Gal/Raf含Leu板、Gal/Raf缺Leu报告板及Gal/Raf含Leu+X-gal显色板点每梯度5 μL。
- 点样完全吸收后30°C倒置;每天在同一光照/倍率拍全板,连续记录至第3–5天,不只拍最终最蓝一天。
- 先确认五组在含Leu维护/诱导板有可比生长,已知互作阳性在缺Leu板生长且含Leu的X-gal板显蓝、双空低背景。
- 检查bait+空B42:若缺Leu板生长或含Leu/X-gal板显蓝,标记bait自激活,暂停该bait的互作结论,考虑合理截短/更换检测体系。
- 检查空LexA+prey与双空,若prey组也阳性,先排查非特异激活、交叉污染和标记错误。
- 只有bait+prey相对两单边和双空均增加,且LEU2与lacZ同时符合预设判据,才登记为候选;保留葡萄糖非诱导照片。
- 对候选与阴性核查LexA-bait及B42-prey表达,阴性但蛋白缺失不能解释为不互作;表达分析是独立验证任务,保存原始印迹。
- 从原保种重新划线,以至少三个独立克隆重复;交换融合方向仅在表达与定位允许时作为另一验证,不把阴性反向实验强行解释。
- 用独立互作方法继续验证候选,保存板图、逐日照片、菌株/序列和全部对照;报告培养条件、阳性判据和限制。
09结果判断与质控
双空和两个单边低背景、阳性有效且试验配对在独立克隆稳定激活LEU2/lacZ,才获得候选互作证据。论文图可展示自激活与表达对照,不作为本批配对成功数据。X-gal只定性/半定量,不能将蓝色深浅直接换算结合常数。

原Fig7完整保留A TBP/TFIIB/TFIIH的LexA诱饵转录激活检查,B融合蛋白与PGK表达对照,C这些诱饵与B42-W7等原图构建体的双杂交组合、培养和lacZ结果。图中构建体及蛋白为原论文实例;本篇须保留各自空载体、自激活与表达对照,不能从一组蓝色直接判定所有诱饵与W7互作。
10实验记录模板
| 宿主/三载体/序列 | 配对/独立克隆 | 维护/诱导OD | 培养基/糖/X-gal | 梯度/μL/天数 | LEU2/lacZ/单边 | 表达/原图 | 候选/未决验证 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 |
另记日期、操作者、试剂批次、设备型号、原始文件路径、偏离方案及原因;保存所有对照,失败批次也保留。
11常见问题与排错
全部不蓝也不长
先看阳性、Leu补回板与诱导糖;检查三载体是否保有及蛋白表达。
bait单独阳性
属于自激活,先重构bait或采用另一互作方法,不能直接减去背景声称阳性。
生长与显色冲突
复核板配方、lacZ显色条件及宿主背景;保留两报告原始结果,不选择性报告。
12参考资料
- 旧网络手册物理第113–133页,特别第119–128页:EGY48/pLexA/pB42AD/p8op-lacZ标记、Gal/Raf诱导、单边及LEU2/lacZ双报告对照;不采用旧病毒阳性蛋白或文库大规模扩增。
- Lin等,A tryptophan-rich peptide acts as a transcription activation domain,BMC Molecular Biology,2010,PMC2992532,查阅2026-11-02:已读全文方法、图1与图7;核对EGY48、pGilda-HIS3、p8oplacZ-URA3、LEU2/lacZ、自激活与表达验证,以及LexA-TFIIB/B42-W7同体系互作。Gal/Raf时间和X-gal板为旧法限定教学起点,须阳性与生长对照验证,不冒称该论文逐项验证本配液。
做完最后一步,再核对原始记录。填写实际用量、起止时间与观察结果;遇到异常,先记录,再查看排错说明。