01本篇适用条件
从非致病BL21(DE3)表达的无害His-GFP澄清裂解液5 mL开始,目标蛋白估计不超过0.5 mg,使用0.5 mL沉降体积Ni-NTA琼脂糖及重力柱。仅处理已证明可溶的蛋白;树脂须有批次兼容性文件与≥1 mg结合容量。需带教使用层析柱与蛋白检测。
02实验原理
组氨酸标签配位结合固定镍,低浓度咪唑降低非特异吸附,高浓度咪唑竞争洗脱。输入、流穿、洗涤及每个洗脱均保留,依SDS-PAGE和GFP荧光而非颜色决定合并。
03安全与适用范围
镍盐/含镍树脂和咪唑废物单独收集,不排下水。保持蛋白4°C或冰上,不用EDTA、强还原剂或低pH随意处理树脂;戴手套,避免树脂粉末与污染性气溶胶。
04材料与仪器
5 mL澄清His-GFP裂解液、Ni-NTA50%浆液1 mL、重力柱、冷室/冰盒、收集管;1 M Tris-HCl pH8.0、5 M NaCl、1 M咪唑pH8.0储液、超纯水;蛋白定量与SDS-PAGE设备。
05配液与用量
| 配50 mL | 结合液 | 洗涤液 | 洗脱液 |
|---|---|---|---|
| 1 M Tris-HCl pH8.0 | 2.5 mL | 2.5 mL | 2.5 mL |
| 5 M NaCl | 3.0 mL | 3.0 mL | 3.0 mL |
| 1 M咪唑pH8.0 | 0.5 mL | 1.0 mL | 12.5 mL |
| 水补足 | 至50 mL | 至50 mL | 至50 mL |
| 终浓度 | 50 mM Tris/300 mM NaCl/10 mM咪唑 | 同基液/20 mM咪唑 | 同基液/250 mM咪唑 |
柱体积CV=0.5 mL;平衡10 CV=5 mL、洗涤20 CV=10 mL、洗脱6 CV=3 mL,分6×0.5 mL。裂解液应在结合液中,必要时先透析;不能只靠小体积高浓盐使不明基质“变合适”。
06时间安排
| 阶段 | 时间 | 温度 |
|---|---|---|
| 缓冲液与装柱 | 30分钟 | 室温配液后冷却 |
| 上样结合 | 约30–60分钟 | 4°C |
| 洗涤与分级洗脱 | 30–45分钟 | 4°C |
| 分级检测 | 60分钟以上 | 依检测法 |
07开始前的准备
测输入浓度并预留50 μL;确认裂解液无可见颗粒,需再澄清时10000×g、4°C20分钟并记录损失。清楚树脂浆液浓度,50%浆液1 mL不是1 mL CV。本配方为低负载教学设置,首次用目标蛋白时保留所有流分验证。
08逐步操作
- 配三种缓冲液,分别补足到50 mL,测量并记录pH及测量温度;冷却至4°C。
- 标记输入I、流穿FT、洗涤W1/W2及洗脱E1–E6管,记录5 mL样本的浓度和目标质量估计。
- 轻轻混匀50%Ni-NTA浆液,取1 mL浆液装柱,重力沉降得到0.5 mL树脂床。
- 放尽保存液至液面刚接近树脂床,立刻分次加入总5 mL结合液平衡,始终保持床面湿润。
- 取50 μL输入保留后,把其余裂解液缓慢加柱,调节流速约0.2–0.5 mL/分钟,完整收集FT并量体积。
- 将FT再过柱一次作为本例充分结合步骤,收集最终FT;如流穿仍大量绿色,保留等待检测。
- 分两次各加5 mL洗涤液,分别收W1/W2,不能倒掉全部后才怀疑目标流失。
- 让残余洗液下降至床面上方,加入0.5 mL洗脱液,收集E1;不要把空气吸进树脂。

完整保留亲和层析全部panel;本篇His标签用咪唑竞争洗脱,不把通用配基或其他洗脱方式直接移植。
EMBL Protein Expression and Purification Core Facility,Affinity chromatography,查阅2026-11-02来源机构版权;公开技术资料完整图教学引用,未声明开放许可;不含购买链接查看技术来源 ↗点击图片查看原图 ↗ - 依次再加5份0.5 mL洗脱液,收集E2–E6,所有管冰上放置,记录实际回收体积。
- 各流分取等体积做快速荧光检查;按已验证兼容方法测总蛋白,咪唑基质用对应空白。
- 把I、FT、W1/W2及E1–E6上SDS-PAGE,记录各自稀释倍数;用身份检测确认目标条带。
- 只合并目标丰富且污染较少的连续洗脱管,记录合并体积,必要时透析去咪唑后再做活性检测。
- 核算回收质量与分布;树脂按本地已验证再生流程处理或作为含镍固废,不在本文临时配再生酸。
09结果判断与质控
主要目标应在洗脱组分,FT与W中显著目标提示结合或洗涤不合适。用质量回收和胶图评价,不宣称一次柱必达某纯度。GFP荧光提示构象但不代替身份鉴定;本方案不适用于变性8 M尿素样本。
10实验记录模板
| 样本/目标 | CV mL | 缓冲液/pH/温度 | I/FT/W/E编号 | 实际体积 | 蛋白浓度 | 目标条带/荧光 | 合并与质量回收 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 |
11常见问题与排错
不结合:查pH、标签、EDTA及输入负载。杂带多:先核对洗涤及输入质量,小试优化而不一次大幅提高咪唑。蛋白沉淀:保留沉淀和上清,检查冷却、盐及浓度,不能只测澄清液便称高回收。
12参考资料
旧来源:网络手册物理168页、短版12–13页(原文为变性Ni-NTA路线,缺少完整缓冲液,故不直接移植)。现代核对:EMBL PEPCF,Affinity chromatography及Choice of lysis buffer,查阅2026-11-02;核对澄清上样、结合/洗涤/竞争洗脱、His标签250 mM–1 M咪唑洗脱及避免EDTA。本文明确采用原生低负载250 mM咪唑教学路线,缓冲体积与CV独立复算。
做完最后一步,再核对原始记录。填写实际用量、起止时间与观察结果;遇到异常,先记录,再查看排错说明。