01本篇适用条件
固定为TRIzol型酚/异硫氰酸胍单相裂解法,起始为一个约3.5 cm培养皿中的约1×10⁶普通非感染性贴壁细胞,每份1 mL裂解剂,目标重溶30 μL。不同组织、细菌、植物和试剂微量提取盒不可照搬。处理后做表达实验需另外检查基因组DNA残留并设置NoRT;本流程不承诺提取物已经无DNA。
02实验原理
胍盐和酚使细胞迅速裂解并抑制核酸酶;氯仿后离心分为水相、界面和有机相,RNA主要位于上层水相。异丙醇让RNA沉淀,75%乙醇洗盐,RNase-free水重溶。最关键的手上动作是取水相时不碰界面、工作区RNase-free、严禁含胍废物接触漂白剂。
03安全与适用范围
TRIzol/苯酚和氯仿有毒且刺激性强,必须按本机构风险评估在化学通风橱内操作,穿实验服、护目镜及适配手套;不要在超净台中操作挥发性有机溶剂。苯酚/氯仿、有机相、含胍裂解液分流收集;含异硫氰酸胍的废液绝不加漂白剂,避免生成有毒气体。按SDS和危废制度处置。
04材料与仪器
- 普通贴壁细胞、TRIzol、氯仿、异丙醇、75%乙醇、RNase-free水;不在加裂解剂前PBS冲洗。
- RNase-free管和枪头、P100/P200/P1000、细胞培养皿、耐有机溶剂离心管。
- 可在4°C达12,000×g的微量离心机、化学通风橱、55°C热块、冰盒、计时器;适当的RNA定量与完整性检测设备。
- 独立、已清洁的RNA工作区;标记含苯酚、氯仿、异丙醇与胍的独立废液容器。
05配液与用量
| 每个样本/阶段 | 体积 | 核对 |
|---|---|---|
| TRIzol裂解 | 1,000 μL | 约1×10⁵–1×10⁷贴壁细胞;本例约10⁶ |
| 氯仿 | 200 μL | 每1 mL原始TRIzol,不按取出的水相量算 |
| 异丙醇 | 500 μL | 每1 mL原始TRIzol;不是水相的一半 |
| 75%乙醇洗 | 1,000 μL | 由无水乙醇配制;每1 mL原始TRIzol一次 |
| RNA重溶 | 30 μL | RNase-free水;可在20–50 μL范围按需要调整 |
| 加热溶解 | 55°C | 约10分钟,55–60°C均为参考窗口 |
配10 mL 75%乙醇:7.5 mL无水乙醇,以RNase-free水补至10 mL。体积以最终刻度为准。
06时间安排
| 阶段 | 设置 | 用时 |
|---|---|---|
| 化学橱准备/裂解 | 室温;1 mL TRIzol | 10分钟+静置5分钟 |
| 氯仿分相 | 室温静置2–3分钟;12,000×g、4°C | 18分钟 |
| 水相转移/异丙醇沉淀 | 室温10分钟;12,000×g、4°C | 22分钟 |
| 75%乙醇洗涤 | 7,500×g、4°C | 10分钟 |
| 风干、重溶、检查 | 室温风干5–10分钟;55°C溶解 | 25–45分钟 |
07开始前的准备
先把通风橱内外的物品分区:外部放冰盒、干净枪头和RNA-free管;橱内只放当前有机试剂和废液。离心管确认耐苯酚/氯仿并适配转子;对称配平至制造商要求。细胞处理结束后立即裂解,或按已验证的快速冻存方案冻存。切勿在RNA样本旁使用RNA酶、普通手套触摸管口或共用有污染的移液器。
| 仪器/参数 | 本例设置 | 如何调整与核对 |
|---|---|---|
| 化学通风橱 | 经检验可用的化学通风橱 | 按SDS控制酚/氯仿暴露;不是超净台 |
| 冷离心机分相 | 4°C、12,000×g、15分钟 | 管/转子必须耐化学试剂及此转速 |
| 冷离心机沉淀 | 4°C、12,000×g、10分钟 | 配平,记铰链方向定位沉淀 |
| 乙醇洗涤离心 | 4°C、7,500×g、5分钟 | 不误输入成rpm |
| 热块 | 55°C、10分钟 | 用适配管孔;可按原厂55–60°C窗口调整 |
| RNA检测 | RNA HS荧光法、UV/完整性按需 | 各读数分开解释,不把UV比值当RIN |
08逐步操作
- 换新手套,清洁专用工作区并标记S1等样本管、TRIzol废液和有机废液容器;检查离心机已预冷4°C。

原创教学图解:RNA酶污染控制和有机危废分流图。
本站原创绘制,参数依照文中限定体系;非原始文献截图。本站原创教学图解。允许随本方法页学习使用;不得误标为实测数据。点击图片查看原图 ↗ - 记录细胞系、培养皿大小、融合度、处理条件、收样时间及估计细胞数。
- 从培养箱取皿后吸尽培养液。不先PBS洗涤,避免增加操作时间和RNA降解风险。
- 在皿内直接加入1 mL TRIzol,立即覆盖整个生长面;P1000缓慢吸打数次使细胞裂解匀浆。
- 将匀浆转移到耐有机试剂管;沿皿面冲洗残留裂解液并合并,盖紧。
- 室温放置5分钟,使核蛋白复合物充分解离;开始时记录计时,不要跳过。
- 每管加入200 μL氯仿,立即盖紧;在化学通风橱中用手剧烈振荡约15秒,直至均匀乳浊。
- 室温放置2–3分钟,过程中不反复开盖闻味或振荡。
- 4°C、12,000×g离心15分钟。确认输入栏是×g;如果仪器只有rpm,需要按转子半径换算,不能照抄其他离心机的rpm。
- 取出后可见上层无色/淡色水相、中间界面和下层有机相。保持管垂直,估计水相体积约400–500 μL。
- 用P200或适配枪头沿管壁慢慢转移上层水相到新RNase-free管,界面上方留约2–3 mm液层不取。宁少勿带界面。

原创教学图解:TRIzol分相示意(非真实离心管照片)。
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原创教学图解:TRIzol分层管和取水相枪头位置的原创教学示意,非实验实拍。
本站原创绘制,参数依照文中限定体系;非原始文献截图。本站原创教学图解。允许随本方法页学习使用;不得误标为实测数据。点击图片查看原图 ↗ - 加入500 μL异丙醇(按最初1 mL TRIzol计),轻柔颠倒混匀10次,盖紧室温静置10分钟。

原创教学图解:TRIzol沉淀与洗涤阶段的教学流程。
本站原创绘制,参数依照文中限定体系;非原始文献截图。本站原创教学图解。允许随本方法页学习使用;不得误标为实测数据。点击图片查看原图 ↗ - 4°C、12,000×g离心10分钟。开盖前标记铰链方向以便定位可能不可见的RNA沉淀。
- 缓慢吸走上清,不让枪头触及沉淀区域;如果不确定沉淀在哪一侧,先少吸一部分再旋转管观察。
- 沿与沉淀相反的内壁加入1 mL 75%乙醇,轻轻颠倒洗涤;4°C、7,500×g离心5分钟。
- 吸去乙醇,短暂再离心使残液汇集管底,用P20小心移走最后液滴;避免直接戳沉淀。
- 开盖室温风干5–10分钟,看到无明显乙醇液滴即可。不要风干至硬透明薄膜,过干会很难溶解。
- 加30 μL RNase-free水,盖好并在55°C加热10分钟;轻弹/缓慢吹吸帮助溶解,不要剧烈涡旋。
- 取少量测RNA浓度和纯度,另取等量样本跑变性胶或使用适合RNA的完整性分析平台。定量前轻混并短暂离心。
- 记录浓度、总量、A260/280、A260/230及完整性;做表达分析前用匹配DNase方案处理并保留NoRT。分装保存于经验证的−80°C条件,避免反复冻融。
09结果判断与质控
良好样本应能重溶,Qubit RNA HS给出高于定量下限且重复性合理的浓度;RNA电泳可见与物种/样本一致的主要核糖体RNA信号。概念示意图会展示“完整、降解、酚污染时”的外观趋势,不模拟真实峰值/RIN。A260/280约2.0只是常见参考,A260/230偏低可见于盐、胍、酚等残留;不能仅凭一个比值宣布合格。
10实验记录模板
| 样本 | 细胞系/数量 | TRIzol/氯仿/异丙醇 | 水相转移μL | 离心×g/温度 | 乙醇洗涤 | 重溶μL | RNA ng/μL/总量 | A260/280 | A260/230 | 完整性 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 待填 | 待填 | 1000/200/500 | 待填 | 待填 | 1 mL/5 min | 30 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 |
11常见问题与排错
RNA浓度低
核对细胞数量、裂解覆盖、是否丢失沉淀、空白与移液器;起始少于1×10⁶细胞或少于10 mg组织时,原厂允许在水相中加5–10 μg RNase-free糖原(glycogen)辅助沉淀;本例约10⁶细胞不默认需要。糖原不是载体RNA,不能用外源RNA替代,否则会影响定量及RT输入。
A260/230低或RT/qPCR受抑
考虑水相带入界面/苯酚、胍或洗液残留。用适合RNA的cleanup/DNase体系处理,再重新定量,不要靠多加逆转录酶补偿污染。
样品快速降解
排查RNA酶污染、收样至裂解延迟、管口/枪头污染和冻融;先用阳性RNA参考品确认分析仪器。
RNA有DNA信号
TRIzol本身不保证完全除DNA。按下游目的做DNase及纯化,并设置NoRT对照。
12参考资料
- Thermo Fisher, *TRIzol Reagent User Guide*, Rev D, physical pp.1–2。本文采用官方相分离与沉淀比例,步骤解释及QA为原创编辑。
- 本站原创流程和RNA质量概念图;不将图作为实测RNA或RIN。参数边界与SDS提示见
beginner-source-review.md。
做完最后一步,再核对原始记录。填写实际用量、起止时间与观察结果;遇到异常,先记录,再查看排错说明。