01本篇适用条件
本例固定使用已完成逆转录并1:5稀释的cDNA、Power SYBR Green PCR Master Mix(标准非Fast模式)和ABI 7500 Standard run mode。每反应20 μL;每个目标基因比较样本A/B的RT+、匹配NoRT和NTC,均三复孔。300 nM每条引物只是起始浓度,须先验证效率及特异性。不得把PowerUp/Fast试剂程序或另一仪器的被动参比设置混入。
02实验原理
SYBR染料与双链DNA结合,因此既会报告特异扩增产物,也会报告非特异产物/引物二聚体。实时扩增曲线用于Cq判读,熔解曲线检查产物热稳定性特征;单峰只是必要线索之一,不能单独证明序列正确。NTC看配液污染/二聚体,NoRT看基因组DNA,两者都要。
03安全与适用范围
本例是常规非感染性核酸分析。按SYBR和试剂SDS佩戴手套/护目镜;将配液、模板加入与扩增后开盖区域分开。qPCR产物浓度很高,严禁把跑完的板带回pre-PCR区打开;按本机构核酸污染规范处理。
04材料与仪器
- Power SYBR 2×master mix、经验证的正反引物10 μM、无核酸酶水、稀释cDNA、NoRT、NTC水。
- 光学96孔反应板、配套透明光学封膜、板离心机、冰盒、P10/P20与滤芯枪头。
- ABI 7500实时PCR仪,选择Standard而非Fast模式;SYBR Green reporter;试剂自带ROX体系按软件选择ROX passive reference;不另加ROX。
- 有效SYBR校准/染料设置、引物验证记录、孔位图、阳性参考模板和无模板对照。
05配液与用量
每孔20 μL:2×Power SYBR Mix 10 μL、正向10 μM引物0.6 μL、反向10 μM 0.6 μL、无核酸酶水6.8 μL、模板2 μL;引物终浓度各300 nM。NTC将2 μL模板替换成2 μL水,NoRT替换为对应NoRT稀释液。
| 2样本×RT+/NoRT+NTC三复孔 | 孔数 | 17份余量master mix |
|---|---|---|
| 每基因 | 15 | Mix 170 μL+正引物10.2 μL+反引物10.2 μL+水115.6 μL=306 μL |
| 两个基因 | 30 | 每基因单独配一管,勿共用不同引物的master mix |
| 每孔分装 | 18 μL | 之后单独加入2 μL对应模板/水 |
本例按17份配母液,每条引物实际一次加入10.2 μL,无需逐孔移0.6 μL。若必须配单孔而0.6 μL移液不准,可将10 μM引物以1:2稀释为5 μM工作液(例如20 μL引物+20 μL水):正反各1.2 μL,水改为5.6 μL,2×Mix仍10 μL、模板仍2 μL,总体积20 μL、引物各300 nM。勿把较稀引物代入原10 μM配方。
06时间安排
| 阶段 | 时间 |
|---|---|
| 检查样本、板图和试剂 | 15分钟 |
| 配引物稀释液与master mix | 20分钟 |
| 加样、封板、离心 | 20–30分钟 |
| ABI 7500运行 | 约1.5小时 |
| QC及曲线检查 | 20分钟 |
07开始前的准备
先对照引物记录确认基因、物种、扩增子长度、方向和效率。不要只拿教程里的例子代替已验证引物。规划孔位,尽量使条件在板上分布均衡、避免只占板角;NTC三孔和NoRT三孔分开安排。准备同批cDNA、NoRT、阳性参考品,所有模板在冰上解冻并轻混。
| ABI7500参数 | 本例设置 | 核对方法 |
|---|---|---|
| 板型/体积 | 96孔光学板、20 μL | 检查模块兼容及板图方向 |
| 运行模式 | Standard,非Fast | 与Power SYBR试剂对应 |
| Reporter/参比 | SYBR / ROX | 该Mix含ROX,不额外添加;确认染料校准 |
| 激活/循环 | 95°C10min;40×95°C15s/60°C1min | 60°C步采荧光;不采用另一Mix程序 |
| 熔解 | 本机/体系推荐解离程序 | 记录温区、升温速率、采集设置 |
| 分析 | 逐目标统一基线/阈值逻辑 | 阈值位于指数期,不逐孔追调 |
08逐步操作
- 核对ABI7500模块、熔解曲线功能、SYBR通道校准状态、标准96孔光学耗材和Standard run mode。
- 为每孔编号,先写清A RT+、A NoRT、B RT+、B NoRT、NTC的孔位;每条件三个技术复孔。

原创教学图解:96孔板条件分组与对照布局概念图。
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原创教学图解:两基因、两样本RT+/NoRT和NTC三复孔的原创96孔板教学布局。
本站原创绘制,参数依照文中限定体系;非原始文献截图。本站原创教学图解。允许随本方法页学习使用;不得误标为实测数据。点击图片查看原图 ↗ - 检查引物工作液浓度均为10 μM、冻融次数和序列记录;不同目标基因分开准备master mix。
- 冰上融化2×SYBR Mix,避光保存并轻柔混匀;短暂离心收集液体。
- 计算每个目标15孔,另加2孔移液余量,按17孔计算所有无模板组分。
- 每目标配306 μL mix:170 μL 2×Mix+10.2 μL Forward+10.2 μL Reverse+115.6 μL水;每次加入后更换枪头。
- 轻柔混匀、短暂离心。避开剧烈涡旋导致气泡,放冰上等待。
- 每孔加18 μL相应引物mix,分装时枪头贴孔壁、移液速度慢,避免枪头碰邻孔液滴。

原创教学图解:每孔反应体系体积拆解图。
本站原创绘制,参数依照文中限定体系;非原始文献截图。本站原创教学图解。允许随本方法页学习使用;不得误标为实测数据。点击图片查看原图 ↗ - 单独加入2 μL对应RT+、NoRT或水;NTC最后加水或用单独区域操作,减少阳性模板污染。
- 每条件三复孔使用同一模板母液;模板加完后轻轻敲板或板振荡器短混,不让液体溅到封膜区域。
- 贴紧光学膜,用板离心机短暂离心收集所有液体并去气泡;避免高温导致边缘蒸发。
- 软件中新建SYBR实验,选择96孔板、20 μL反应体积、Standard模式;Reporter选择SYBR,Passive Reference按Power SYBR体系设ROX。
- 设置95°C 10分钟预变性/酶激活,40个循环:95°C 15秒、60°C 1分钟,并在60°C步骤采荧光。
- 加熔解/解离曲线阶段,使用ABI软件或本机Power SYBR程序推荐的升温范围、斜率及读数设置;保存并记录实际Ramp,不臆造统一升温速率。

原创教学图解:ABI 7500 Standard与Power SYBR教学设置摘要。
本站原创绘制,参数依照文中限定体系;非原始文献截图。本站原创教学图解。允许随本方法页学习使用;不得误标为实测数据。点击图片查看原图 ↗ - 选择对应孔位的目标名、样本名和重复编号;检查NTC/NoRT标识,不把软件自动命名留作最终记录。
- 上机前查看板膜平整、无气泡、无漏加孔;在软件中再次核对板型、体积、SYBR/ROX和程序并截图存档。
- 运行并观察扩增过程中是否有异常温度/信号错误;若中途报错,保存运行文件和日志后判断是否需整板重跑。
- 运行后先看扩增曲线是否呈S形、基线期合理、三复孔一致;在所有样本间使用统一分析设置。
- 再看熔解曲线:目标样本应出现主要单峰,NTC不应出现与目标相同的明显产物峰;查看NoRT是否有放大。
- 保存原始EDS/仪器文件、导出表、板图、阈值/基线设置、熔解曲线和异常记录;按pre-PCR区域规程处置封板。
09结果判断与质控
教学模拟扩增图中有效模板出现可重复S形,NTC不出目标峰,NoRT明显晚于RT+或未检出;熔解曲线显示一个主峰。Cq40处的Undetermined按缺失处理,不用40代入ΔCq。三个技术复孔只反映移液/检测重复性,不是n=3独立实验。出现多峰、拖尾、NTC峰或引物效率未知时,先优化再做表达结论。
10实验记录模板
| 日期/仪器 | 目标/引物批次 | 反应批号 | Standard/Fast | Mix/引物终浓度 | 体积/ROX | 程序 | 样本/孔位 | RT+/NoRT/NTC Cq | 熔解峰 | 异常 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 待填 | 待填 | 待填 | Standard | 1×/300nM起点 | 20 μL/按体系ROX | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 | 待填 |
11常见问题与排错
NTC有早期扩增
停止解释表达量,检查配液区扩增子污染、引物特异性和样本枪头交叉;清洁并重配,不能只删NTC孔。
熔解曲线多峰
检查引物、退火温度和模板输入;跑胶或测序确认目标条带。优化引物浓度/温度须预先设计并整批一致。
三复孔Cq差异大
检查气泡、加样体积、混匀、封膜、板边蒸发和低拷贝随机性;不要只删离群孔,先按预设规则判断。
所有Cq都靠后
核对RNA输入等效量、逆转录、引物效率、抑制物、通道设置与体系兼容性;用阳性参考品定位问题。
12参考资料
- Applied Biosystems, *Power SYBR Green PCR Master Mix User Guide*:前轮取得的官方46页PDF,物理pp.10、24–25、28–30;该体系含ROX且允许标准模式。
- 本站原创板图与模拟曲线,图内/图注标“教学模拟,非实验数据”。不声称所有ABI固件页面相同;版本差异按本机手册记录。
做完最后一步,再核对原始记录。填写实际用量、起止时间与观察结果;遇到异常,先记录,再查看排错说明。