01本篇适用条件
适用于已经获得合格单细胞悬液、准备采集或分析常规细胞流式数据的研究实验。终点是可追溯的稳定时间段→细胞候选→单细胞→活细胞→表型路径及每层事件数。分析中去掉团块不能补救严重制样失败;本页不适用于用常规细胞阈值直接分析外泌体、血小板或其他小颗粒。
FSC与细胞大小、折射率及光学配置相关,SSC与结构和折射率相关,均非细胞身份或存活的直接证据。低FSC/SSC不一定全是死细胞;HeLa等贴壁细胞不能因散射位置类似某群就命名“淋巴细胞”。死亡排除应使用兼容的活死染料和对照。
02实验原理
先检查进样是否稳定,再用较宽的散射候选门避免选择性丢失活化、大型或濒死群。FSC-A/H或A/W等脉冲关系可识别部分聚集事件,但单细胞带不必呈45度;坐标缩放、探测器和细胞形态都会改变外观。活死门顺序可依样本调整,必须记录并回门验证;活单细胞分析也应保留此前排除的比例。

用示意理解FSC和SSC对不同细胞特征的敏感性;散射还受折射率、波长和仪器设置影响,FSC与SSC均不是细胞身份或存活的特异证据。

左图对应鞘液聚焦样本流,右图对应激发、分光及信号接收;两幅原理图均保留。设备结构为概念示意,实际激光器、滤光片及探测通道以本机配置为准。
03安全与适用范围
操作流式仪需平台培训;疑似堵管、压力异常或泄漏时依设施SOP处理,不自行拆压力管路。未固定样本使用规定生物安全条件,过滤和混匀应避免气溶胶。
04材料与仪器
合格细胞悬液;兼容的活死染料与阳性/阴性控制;FSC-A/H及可用W、SSC参数;时间参数;代表性阳性与阴性样本;正确补偿或解混结果;用于回门的分析软件与原始FCS。
05配液与用量
| 节点/参数 | 教学分析动作 | 不应据此断言 |
|---|---|---|
| Time与事件率 | 圈定稳定区,标记突变段 | 所有低事件率段都必然无效 |
| FSC-A/SSC-A | 宽门选择候选细胞并回查边缘 | 门内已是某一免疫细胞身份 |
| FSC-A/FSC-H | 沿本机实测单细胞主带圈门 | 只有45度线才是单细胞 |
| 额外W或SSC脉冲 | 对聚集明显样本补充验证 | 任何一个脉冲门都能排除全部团块 |
| 活死染料 | 在匹配对照中识别活细胞区 | 散射小的就都死、染色阴性永远都活 |
事件预算示例:目标需20000个活单细胞,候选细胞占80%、其中单细胞90%、其中活细胞85%,粗略需20000÷(0.80×0.90×0.85)≈32680个稳定采集事件。比例为示例,真实停机目标应以实际合格事件数检查。
06时间安排
| 时段 | 检查 | 决策 |
|---|---|---|
| 上机前 | 悬液、活率、团块和参数保存 | 严重团块先重制样 |
| 初次试读 | 阈值、事件率、脉冲范围 | 防止排除尚未保存的目标群 |
| 每管采集 | 时间与信号稳定性 | 异常按平台SOP处理并记录 |
| 离线分析 | 每层损失与回门 | 无法恢复的采集丢失写入局限 |
07开始前的准备
仪器采集前确认保存时间和脉冲参数,否则后期无法补算。阈值过高导致未被记录的事件无法通过移动分析门恢复,应先用代表性样本试读。活死染料依是否固定、缓冲蛋白及细胞类型选择;“阴性为活”适用于已验证的染料机制和对照,不能脱离试剂类型一律使用。
08逐步操作
- 查看悬液是否有肉眼团块、明显碎屑和异常低活率,记录制样情况,必要时先改善制样再采集。
- 在仪器模板加入时间、FSC-A/H及可用W、SSC和所有荧光参数,确认不会漏存关键脉冲信息。
- 用代表样本低速试读,调整阈值和散射范围,保留预期小型及大型目标,避免在采集阶段不可逆丢失。
- 采集活死染料控制与补偿所需单染,确保亮阳性不饱和,核对样本固定和染料兼容。
- 观察时间对事件率或散射信号,标记起始不稳、气泡和堵管相关突变,按预设规则选稳定时间段。
- 在稳定事件中以FSC-A/SSC-A建立宽的候选细胞门,不直接把某个散射岛命名为确定细胞类型。
- 用FSC-A/FSC-H等实测脉冲关系圈主单细胞带,检查大细胞群是否被过度排除,不套用固定45度。

将脉冲定义与FSC-A对FSC-H的对角单细胞群对应;双细胞的H、A和W关系会随取向与仪器变化,应结合样本实测,不能把固定斜率当作通用规则。
《流式配色原则及技巧详解》,版本2026.07,物理PDF第16页用户提供文档,技术图局部摘录点击图片查看原图 ↗ - 对疑似聚集使用宽度或其他脉冲关系补充检查,结合上机浓度和流速判断重合事件,不靠无限收窄门解决。
- 依据匹配的活死染料对照选择活细胞区,记录活死比例;异常高死亡应回查制样与延迟而非只删掉。

从左到右查看父门如何传递到单细胞及活细胞;百分比仅属于原示例父群,死活染阈值须用本批样本及阳性对照确定。
《流式配色原则及技巧详解》,版本2026.07,物理PDF第14页用户提供文档,技术图局部摘录点击图片查看原图 ↗ - 在活单细胞内用合适表型组合定义目标谱系与亚群,散射位置只能作辅助证据。
- 将终点和各排除群回门到散射、时间、单细胞及活死图,核查是否系统性排除了处理组的真实目标。
- 导出每层事件数、父群比例、总事件比例和门图,保留原始FCS;报告未达事件目标或严重制样失败的样本。
09结果判断与质控
示例100000稳定事件→80000候选细胞→72000单细胞→61200活细胞→6120目标:目标占活单细胞10%,占稳定全部事件6.12%,二者不可混写。单细胞门后活率61200/72000=85%。如果研究问题就是死亡或细胞聚集,活单细胞可作为特定终点的分母,但不能删去死亡/聚集信息后声称总体样本无变化。

比较样本来源改变后淋巴细胞区及单核细胞区的位置;坐标范围和圈门不能跨物种或跨仪器照搬,低FSC区域也不能单独等同于死细胞。

五种原始显示方式均保留,理解显示密度和轮廓不改变原事件或父群分母。图组并非五个独立重复,百分比不能作为本篇实验结果。

三幅panel完整保留,比较小鼠脾细胞T/B的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。

三幅panel完整保留,比较小鼠骨髓粒细胞的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。

三幅panel完整保留,比较小鼠胸腺T细胞的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。

三幅panel完整保留,比较小鼠血小板的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。

三幅panel完整保留,比较小鼠腹腔巨噬细胞的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。

三幅panel完整保留,比较人PBMC的T/B的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。

三幅panel完整保留,比较人外周血粒细胞的主群、单细胞与终点标志物;样本来源和制备体系均不同于培养细胞篇,仅用于理解父门传递。不得据此采用原页动物取材、免疫处理或血液制备操作,也不能跨样本复制门限。
10实验记录模板
| 样本/设置 | 稳定/候选/单细胞/活细胞数 | 每层父群比例 | 活死染料/对照 | 回门及异常段 | 目标分母/采集局限 |
|---|---|---|---|---|---|
| ______ | ______ | ______ | ______ | ______ | ______ |
11常见问题与排错
团块多:降低制样聚集并核查合适浓度和过滤,不只调门。处理后散射变化:用活死和表型证据回查,不能照抄对照组窄门。单细胞带弯曲或截断:检查信号范围、饱和和仪器设置。死亡极高却最终图很漂亮:追查被排除比例并报告选择偏差。
12参考资料
用户提供《2026-panel-design》,2026版,PDF物理第14–16页(册内第12–14页),活细胞、散射及聚集去除。事件数与回收算式为教学例;散射不是身份、脉冲角度不固定、阈值造成的丢失不可恢复等边界已明确。
做完最后一步,再核对原始记录。填写实际用量、起止时间与观察结果;遇到异常,先记录,再查看排错说明。